凝膠滲透色譜技術是根據溶質(被分離物質)分子量的不同,通過具有分子篩性質的固定相(凝膠),使物質達到分離。凝膠滲透色譜法最初主要用來分離蛋白質,但隨著適用于非水溶劑分離的凝膠類型的增加,凝膠滲透技術應用于農藥殘留量凈化得以發展。凝膠滲透色譜的最佳參數主要決定于載體、溶劑的選擇。載體凝膠滲透色譜是具有分離作用的關鍵,其結構直接影響儀器性能及分離效果。因此,要求載體具有良好的化學惰性、熱穩定性、一定的機械強度、不易變形、流動阻力小、不吸附待測物質、分離范圍廣(取決于載體的孔徑分布)等性質。

同時分離效果還與載體的粒度大小和填充密度有關。為了擴大分離范圍和分離容量,一般選擇幾種不同孔徑的載體混合裝柱,或串聯裝有不同載體的色譜柱,其中載體的粒度越小、越均勻、填充得越緊密越好。良好的溶劑有利于提高待測物質的溶解度,避免操作時因分析對象的改變而更換溶劑。由于凝膠滲透色譜為液體色譜,則要求溶劑的熔點在室以下,而沸點應高于實驗溫度,且溶劑的粘度小,以減小流動阻力。另外溶劑還必須具備毒性低、易于純化、化學性質穩定及不腐蝕色譜設備的特點。此外,分離效率除了載體、溶劑的選擇以外,還包括合適的溫度和溶質的化學性質的影響。與吸附柱色譜等凈化技術相比,凝膠滲透色譜技術具有凈化容量大、可重復使用、適用范圍廣、使用自動化裝置后凈化時間縮短、簡便、準確等優點。